Россия, Липецк, Липецкий Государственный Технический Университет, 2014 |
Самостоятельная работа 6: Распараллеливание программы вычисления определенного интеграла с помощью OpenMP
Распараллеливание программ с помощью OpenMP
Параллельная OpenMP-программа состоит из последовательных и параллельных секций. Границы параллельных секций обозначаются директивами OpenMP. Процесс разработки OpenMP-программы включает следующие этапы:
- Разработка последовательной программы.
- Выявление участков потенциального параллелизма. Чаще всего это циклы.
- Анализ трудоемкости параллельных секций (профилирование программы). Наибольший выигрыш в производительности дает распараллеливание секций, на которые приходятся наибольшие затраты процессорного времени.
- Пошаговое распараллеливание программы, начиная с наиболее трудоемких секций.
Профилирование может производиться как с помощью специальных программных инструментов, так и простыми средствами, например, с помощью вызова специальных подпрограмм-таймеров, размещенных в различных местах программы.
Цикл эффективно распараллеливается, если отсутствуют перекрестные зависимости между его итерациями. Избавиться от таких зависимостей иногда можно, выполнив преобразование цикла.
Необходимо правильно определить область видимости переменных в параллельных секциях программы. Параметр цикла, например, должен быть объявлен локальной переменной. Инвариант цикла (величина, не изменяющаяся при выполнении итераций цикла) должен быть глобальным.
При вычислении суммы, например, к переменной, которая используется для "накопления" суммы, должна быть применена операция приведения (редукции).
Следует обратить внимание на синхронизацию вычислений. По умолчанию в циклах используется барьерная синхронизация. Наличие синхронизаций увеличивает предсказуемость поведения программы, но замедляет ее работу.
Дополнительный выигрыш в производительности дает объединение нескольких параллельных секций в одну. В этом случае уменьшаются накладные расходы на запуск нитей и их завершение.
Трансляция OpenMP-программ
Трансляция OpenMP-программы выполняется со специальным ключом. В операционной системе Linux транслятор Intel®Compiler использует ключ –openmp, например:
#ifort –o my_prog prog_source.f90 -openmp
В операционной системе Microsoft®Windows командная строка выглядит следующим образом:
#ifort prog_source.f90 /Qopenmp
Приближенное вычисление определенного интеграла
Приближенное вычисление интеграла:
основано на его замене конечной суммой:
где — числовые коэффициенты, а — точки отрезка . Приближенное равенство:
называется квадратурной формулой, точки — узлами квадратурной формулы, а числа — коэффициентами квадратурной формулы. Разные методы приближенного интегрирования отличаются выбором узлов и коэффициентов. От этого выбора зависит погрешность квадратурной формулы:
Метод трапеций
Интегрирование методом трапеций — основано на использовании кусочно-линейного приближения для интегрируемой функции. Пусть — гладкая функция на интервале , и этот интервал делится на равных частей, каждая длиной .
Приближение метода трапеций:
где ,— значение интегрируемой функции в точке .
Метод Симпсона
Идея трехточечного метода Симпсона заключается в следующем. Пусть — это средняя точка интервала и пусть — единственный полином второй степени, который интерполирует (приближает) подынтегральную функцию по точкам , и . Искомый интеграл аппроксимируется интегралом от функции :
Эта оценка точна, если является полиномом степени 3.
Обычно используются составные квадратурные формулы, когда промежуток интегрирования разбивается на подинтервалов и простая формула Симпсона применяется на каждом из этих подинтервалов:
Недостатком рассмотренного метода является то, что он не дает возможности явно задать точность вычисления интеграла. Точность связана с количеством точек разбиения. От этого недостатка свободны методы интегрирования с адаптивным выбором шага разбиения. Если трехточечный метод Симпсона не дает достаточную точность на заданном интервале, он делится на 3 равные части и метод вновь применяется к каждой из полученных частей.
Лабораторная работа
В заданиях лабораторной работы 6 предлагается выполнить распараллеливание последовательных программ, предназначенных для вычисления определенных интегралов. В задании 4 распараллеливание производится с помощью MPI. Цель работы – получить навык анализа простых программ и выявления в них потенциального параллелизма, применить для распараллеливания OpenMP и MPI, сравнить трудоемкость обоих подходов и эффективность полученного результата. Звездочкой отмечено задание повышенной сложности.
Задания для практической работы
Задание 1
Получить у преподавателя файл с исходным текстом программы (примеры 1, 2) и ознакомиться с реализацией квадратурной формулы.
Задание 2
Откомпилировать программу, выполнить расчет. Определить процессорное время, потраченное на выполнение расчета.
Задание 3
Проанализировать последовательный код и выявить участки потенциального параллелизма. Выполнить распараллеливание с помощью OpenMP. Определить процессорное время, потраченное на выполнение расчета для разного числа потоков (меньшего, равного и большего, чем число процессоров). Сравнить с результатом, полученным в задании 2. Объяснить полученный результат.
Задание 4
Распараллелить программу с помощью MPI. Определить процессорное время, потраченное на выполнение расчета. Сравнить с результатами, полученными в заданиях 2 и 3.
Задание 5
На основании результатов, полученных при выполнении заданий данной лабораторной работы, написать отчет, в котором содержатся выводы об эффективности различных способов распараллеливания исходного последовательного кода и трудоемкости реализации этих способов на практике.
Пример 1
В программе на языке Fortran 90 реализован метод трапеций.
program integral_trapez integer, parameter :: div_no = 100 real, parameter :: x0 = 0., x1 = 1. !3.14159 real, external :: F real :: result result = trapezium(F, x0, x1, div_no) print *, result end real function trapezium(F, x0, x1, div_no) real, external :: F real, intent(in) :: x0, x1 integer, intent(in) :: div_no real :: x, dx, sum integer :: j dx = (x1 - x0) / div_no sum = F(x0) + F(x1) x = x0 do j = 1, div_no - 1 x = x + dx sum = sum + 2.0 * F(x) end do trapezium = dx * sum / 2.0 end real function F(x) real, intent(in) :: x !F= sin(x) F = 4./(1.+x**2) end
Пример 2
В программе на языке Fortran 90 реализован метод Симпсона.
program integral_simps integer, parameter :: div_no = 100 real, parameter :: x0 = 0., x1 = 1. !3.14159 real, external :: F real :: result result = simpson(F, x0, x1, div_no) print *, result end real function simpson(F, x0, x1, div_no) real, external :: F real, intent(in) :: x0, x1 integer, intent(in) :: div_no real :: x, dx, sum integer :: j dx = (x1 - x0) / (2.0 * div_no) sum = F(x0) + F(x1) x = x0 do j = 1, 2 * div_no - 1 x = x + dx if (mod(j, 2) /= 0) then sum = sum + 4.0 * F(x) else sum = sum + 2.0 * F(x) end if end do simpson = dx * sum / 3.0 end real function F(x) real, intent(in) :: x !F= sin(x) F = 4./(1.+x**2) end