В то же время проекты внедрения обладают существенными особенностями, которые определяются создаваемым продуктом - действующей информационной системой. Эти особенности проявляются в выборе фаз, на которые делится проект, в составе и последовательности выполнения работ, в организации и задачах проектной команды, в перечне анализируемых рисков и т. д. Указанные аспекты внедрения информационных систем также достаточно хорошо изучены, сформированы рекомендации, что, кому и как следует делать в зависимости от целей внедрения системы, используемого программного продукта и прочих особенностей проекта. Эти рекомендации закреплены в различных методологиях внедрения информационных систем, но особенности управления проектами в этих документах зачастую рассматриваются в усеченном формате.